雲嘉區域網路中心組織運作由雲嘉區域各大專院校、縣市網路中心及部分高中職學校代表組成雲嘉區域網路管理委員會，委員會成員包括嘉義縣教網中心、嘉義市教網中心、雲林縣教網中心、雲林科技大學、嘉義大學、南華大學、虎尾科技大學、環球技術學院、吳鳳技術學院、臺灣體育學院、大同技術學院、稻江科技暨管理學院、中國醫藥大學北港分校、長庚技術學院、崇仁醫專、嘉義高工、東石高中、新港藝術高中、華南商職、協同中學、協志高中、萬能工商、弘德工商及中正大學等共24位成員為當然委員，必要時邀請其他單位參與，本委員會每年召開會議二至四次。